Obory patří mezi evropsky významné lokality a ptačí oblasti v systému NATURA 2000. Vyskytují se zde významné druhy bezobratlých (dvouhrotec zelený, páchník hnědý, roháč obecný, atp.) a ptáků (strakapoud postřední, lejsek bělokrký). Součástí Poněšické obory je i přírodní památka Libochovka s výskytem pérovky pštrosí. Obora se specializuje na chov jelenů.